Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP62P37198 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP62P37198 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP62P37198 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP62P37198 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP62P37198 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP62P37198 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP62P37198 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP62P37198 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms