Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJC1P36383 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJC1P36383 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJC1P36383 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJC1P36383 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJC1P36383 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms