Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms