Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASQ1P31415 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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