Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCKSP29966 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCKSP29966 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms