Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD34P28906 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD34P28906 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD34P28906 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD34P28906 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD34P28906 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD34P28906 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD34P28906 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD34P28906 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CD34P28906 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD34P28906 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms