Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB4P28070 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB4P28070 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms