Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms