Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERBB3P21860 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERBB3P21860 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms