Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA1P14867 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms