Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC166P0CW27 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms