Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA2P01563 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFNA2P01563 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA2P01563 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA2P01563 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA2P01563 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA2P01563 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA2P01563 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA2P01563 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms