Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSD2O96028 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSD2O96028 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NSD2O96028 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NSD2O96028 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSD2O96028 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSD2O96028 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSD2O96028 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NSD2O96028 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms