Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC24BO95487 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEC24BO95487 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms