Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPO95166 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPO95166 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms