Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms