Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR5O75473 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR5O75473 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR5O75473 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR5O75473 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR5O75473 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR5O75473 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR5O75473 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGR5O75473 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGR5O75473 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGR5O75473 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms