Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHACTR2O75167 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHACTR2O75167 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms