Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBNO60934 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBNO60934 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBNO60934 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBNO60934 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBNO60934 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBNO60934 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBNO60934 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBNO60934 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBNO60934 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBNO60934 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBNO60934 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms