Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYO1BO43795 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYO1BO43795 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms