Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM2O43147 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM2O43147 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms