Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms