Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHD1O14646 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD1O14646 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD1O14646 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD1O14646 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD1O14646 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD1O14646 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD1O14646 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD1O14646 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHD1O14646 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHD1O14646 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHD1O14646 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHD1O14646 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHD1O14646 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHD1O14646 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CHD1O14646 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHD1O14646 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD1O14646 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD1O14646 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD1O14646 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD1O14646 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD1O14646 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD1O14646 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD1O14646 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHD1O14646 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHD1O14646 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD1O14646 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD1O14646 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD1O14646 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD1O14646 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD1O14646 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD1O14646 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHD1O14646 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD1O14646 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD1O14646 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD1O14646 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD1O14646 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD1O14646 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD1O14646 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHD1O14646 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHD1O14646 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD1O14646 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD1O14646 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD1O14646 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD1O14646 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD1O14646 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD1O14646 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD1O14646 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD1O14646 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHD1O14646 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHD1O14646 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHD1O14646 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHD1O14646 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHD1O14646 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHD1O14646 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHD1O14646 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHD1O14646 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHD1O14646 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms