Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms