Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F3O00716 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
E2F3O00716 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
E2F3O00716 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
E2F3O00716 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
E2F3O00716 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms