Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP2O00295 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP2O00295 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP2O00295 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP2O00295 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms