Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP23O00161 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms