Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
J3KT08 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
J3KT08 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
J3KT08 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
J3KT08 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
J3KT08 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms