Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGB1P1B2RPK0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms