Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms