Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL33A6NCF5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL33A6NCF5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms