Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms