Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPQ1

Glycine cleavage system H protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPQ1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A1W2PPQ1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms