Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SERP1Q9Y6X1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms