Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms