Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms