Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms