Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LEMD3Q9Y2U8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms