Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF13BQ9Y275 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms