Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYO6Q9UM54 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYO6Q9UM54 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms