Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP8AP2Q9UKL3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms