Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1Q9UJ41 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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RABGEF1Q9UJ41 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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RABGEF1Q9UJ41 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
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RABGEF1Q9UJ41 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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RABGEF1Q9UJ41 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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RABGEF1Q9UJ41 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RABGEF1Q9UJ41 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RABGEF1Q9UJ41 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RABGEF1Q9UJ41 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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