Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUF60Q9UHX1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms