Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPXQ9UHP9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms