Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3BQ9UH17 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms