Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIP2Q9UDT6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms