Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP36Q9P275 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms