Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N8

MARCH2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH2Q9P0N8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH2Q9P0N8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH2Q9P0N8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH2Q9P0N8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH2Q9P0N8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH2Q9P0N8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH2Q9P0N8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH2Q9P0N8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH2Q9P0N8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCH2Q9P0N8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARCH2Q9P0N8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms