Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms