Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDAP2Q9NXN4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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